黄药师，金庸武侠小说《射雕英雄传》和《神雕侠侣》中角色。是桃花岛岛主兼“天下五绝”之一“东邪”。黄蓉之父。
黄药师形相清癯，身材高瘦，风姿隽爽，萧疏轩举，湛然若神。身穿青衣直缀，头戴同色方巾，文士模样。个性离经叛道，狂傲不羁。性情孤僻，行动怪异，身形飘忽，有如鬼魅。
“桃花影落飞神剑，碧海潮生按玉箫”是他一生武功的写照，武功造诣非凡，已臻化境，为金庸小说中武功最绝顶的高手之一。
作者金庸评为“正中带有七分邪，邪中带有三分正”的人物。
是黄蓉之父，对其妻冯氏（小字阿衡）一往情深。
黄药师上通天文，下通地理，五行八卦、奇门遁甲、琴棋书画，甚至农田水利、经济兵略等亦无一不晓，无一不精。
黄药师漠视“传统礼教”，然却最敬重忠臣孝子（据黄药师的说法：此乃大节。）个性行事潇洒。
武学传承方面，武功大都为自创，却没有明言谁为其师，网络传闻其授业恩师乃出身自逍遥派，即《天龙八部》里虚竹之门派。
在《射雕英雄传》故事发生之前，黄药师有曲灵风、陈玄风、梅超风、陆乘风、武罡风、冯默风六大弟子。
首次华山论剑时，黄药师当日以“弹指神通”和“北丐”的“降龙十八掌”、“西毒”的“蛤蟆功”、“南帝”的“一阳指”打成平手。
“老顽童”周伯通在运送《黄药师》下册至藏匿地点的途中遇到黄药师与其新婚妻子冯衡，黄药师二人施计获得《九阴真经》下册经文的内容，周伯通中计下毁去经书；日后周伯通得知其上当于黄药师二人，为防上册经书被盗，于是携带《九阴真经》上册经书前往黄药师居所桃花岛追讨下册经文，其时冯衡已死，黄药师又因周伯通言语相激，与之展开激烈交战，使出“弹指神通”断周伯通双脚，从此困周伯通于岛上十五年。
后来因为陈玄风与梅超风二人盗取《黄药师》叛逃师门，黄药师一怒之下打断曲灵风、陆乘风、武眠风、冯默风四人的腿筋，然后逐出师门。
《射雕英雄传》第十四回黄药师将梅超风、陆乘风重收师门下，然而曲灵风和武眠风已死，黄药师收容遗孤曲傻姑为徒孙。
在郭靖和欧阳锋来桃花岛上向黄蓉求婚，黄药师出了三道题目，郭靖经“北丐”洪七公和周伯通协助下赢得黄蓉。
在临安牛家村曾为互相只认识了先后两天的徒孙陆乘风之子陆冠英和程瑶迦主婚。
因为一番误会之下，在牛家村内与“全真七子”展开激烈交战，黄药师功夫着实了得，在“全真七子”的最大绝学“天罡北斗阵”之下，仍然能凭“落英桃花掌”掌法等高超武功以一敌七维持平手局面。
第二次华山论剑，黄药师的“桃华落英掌”至“奇门五转”多套掌法下，三百招内仍无法撃倒郭靖，自认落败；后来逆练《黄药师》的欧阳锋突然出现，黄药师运起“弹指神通”，哪知遭欧阳锋怪异无伦，一口咬住黄药师中指，无奈之下，连黄药师只得默认他“武功天下第一”。
于《神雕侠侣》内，郭靖、黄蓉参与华山论剑之后，由黄药师主持成亲，在桃花岛归隐，黄药师性情孤僻，不喜热闹，与女儿女婿同处数月，不觉厌烦起来，留下一封书信，要另寻清静之地闲居，径自飘然离岛。
经过江南陆家庄时，黄药师使用“弹指神通”压倒性的力量轻松制服“赤练仙子”李莫愁，并破了她的“冰魄银针”，顺道救了程英，当关门弟子。
因讨厌世俗礼教而和杨过一见如故。
曾经饰演黄药师的演员：
黄药师上终南山拜访王重阳，王重阳告知打赌输于林朝英之事，黄药师帮忙点破林朝英暗藏化石丹 。
“九阴真经”出现在江湖中，引起各路武林人士争夺。王重阳、黄药师、欧阳锋、段智兴、洪七公决定在华山论剑，谁夺得“天下第一”则归谁。黄药师等人败给了王重阳，但黄药师也得到五绝之一“东邪”的称号 。
而后黄药师娶冯衡为妻，早年所收的徒弟除去陈玄风、梅超风、曲灵风、陆乘风四大弟子之外还有两个小弟子武眠风和冯默风。
王重阳逝世后，死前交代周伯通将经书上下卷分开藏匿。“老顽童”周伯通在运送《九阴真经》下卷至藏匿地点的途中遇到黄药师与其新婚妻子冯衡，冯氏凭借过目不忘骗老顽童真经为假，周伯通一怒之下毁去经书，而后冯衡默出《九阴真经》下卷交予黄药师 。
因黄药师只有下卷经书，自负可以从下卷中自创上卷内功基础，因而发誓若不练成经中所载武功，便不离桃花岛一步。
陈玄风、梅超风互生爱慕，恐黄药师性格怪癖不予应允，决定窃取了师父的《九阴真经》下卷。黄药师后来得知，一怒之下挑断其余弟子腿筋，全部逐出师门 。
冯衡为了安慰黄药师，再想把经文默写出来。但因不懂含义多半忘记，因而苦思几日几夜写下了七八千字而导致流产生下黄蓉，自己因此逝世 。
日后周伯通得知其受骗于黄药师二人，为防上册经书被盗，于是携带《九阴真经》上卷经书前往黄药师居所桃花岛追讨经文，其时冯衡已死，黄药师又因周伯通言语相激，与之展开激烈交战，使出“弹指神通”射断周伯通双脚，从此困周伯通于岛上十五年 。多年之后发现黄蓉为周伯通送酒及食物，因而责骂她，黄蓉和父亲赌气从而由浙江一路北上 。
黄药师为了找寻女儿打破誓言离开桃花岛，在太湖归云庄发现了黄蓉、郭靖及为救杨康而来的梅超风。随后黄药师将陆乘风重收门下，授予“旋风扫叶腿法”以便恢复行走，并准许其传授桃花岛武功给陆冠英。并得知武眠风已死，黄药师吩咐梅超风找寻《九阴真经》和将其他弟子及家属带至归云庄。黄药师因觉得郭靖是洪七公的弟子并打败了自己徒弟而觉得气愤，并出手攻击郭靖，但因黄蓉跳入太湖之中要挟而作罢 。
在郭靖和欧阳克来桃花岛上向黄蓉求婚，黄药师出了三道题目，郭靖经“北丐”洪七公和周伯通协助下赢得黄蓉 。 在临安府牛家村，黄药师从沙通天、彭连海、杨康等人手中救下了陆冠英、程瑶迦、傻姑。虽然饶过沙通天等人性命但逼迫他们从自己胯下钻过。尹志平却宁死不从，辱骂黄药师，但黄药师因讨厌仁义礼法而放过他们。随后为互相只认识了先后两天的徒孙陆冠英和程瑶迦主婚 。
后来全真七子被裘千丈所骗误以为周伯通被黄药师所杀，因而在牛家村内与黄药师展开激烈交战，黄药师功夫着实了得，在“全真七子”的最大绝学“天罡北斗阵”之下，仍然能凭“桃华落英掌”掌法等高超武功以一敌七维持平手局面。但欧阳锋突然出手所致谭处端被杀、梅超风受重伤。后江南七怪赶到，黄药师决心为梅超风报仇而准备杀死江南七怪。郭靖、黄蓉出现而作罢，并为受伤的郭靖治好了伤。随后得知了傻姑正是曲灵风之女，因而收下并传授武功。
第二次华山论剑，黄药师的“桃华落英掌”至“奇门五转”多套掌法下，三百招内仍无法击倒郭靖，自认落败；后来逆练《九阴真经》的欧阳锋突然出现，黄药师运起“弹指神通”，哪知遭欧阳锋怪异无伦，一口咬住黄药师食指，无奈之下，连黄药师只得默认他“武功天下第一”。
郭靖、黄蓉参与华山论剑之后，由黄药师主持成婚，在桃花岛归隐，黄药师性情怪僻，不喜热闹，与女儿女婿同处数月，不觉厌烦起来，留下一封书信，要另寻清静之地闲居，径自飘然离岛 。
经过江南陆家庄时，黄药师使用“弹指神通”压倒性的力量轻松制服“赤练仙子”李莫愁，并破了她的“冰魄银针”，顺道救了程英，当关门弟子 。
后来程英、杨过、陆无双遭遇李莫愁，黄药师便帮助解围。与杨过一见如故，并愿意收杨过为徒好让杨过与小龙女在一起，杨过不愿屈服于礼法。后来李莫愁说以多欺少，黄药师不愿与她相争，后来便传授杨过“弹指神通”后离去 。
在郭襄16岁生日之际，利用弹指神通打死霍都，并与杨过一同来到英雄大会比武台。随后杨过使用“黯然销魂掌”与黄药师一同赶跑彭连虎等人，并随后得知世上并无”南海神尼“ 。
蒙古大军围困襄阳、郭襄被金轮法王所抓，黄药师、一灯、周伯通相助郭靖黄蓉守城。黄药师摆下奇门术数二十八宿大阵与蒙古大军周旋，后来杨过赶到击败金轮法王射杀蒙哥，从而解了襄阳之围 。
后黄药师与众人准备去华山祭拜洪七公、欧阳锋，恰逢一群庸人争夺天下第一，赶跑他们之后黄药师等人重新确立天下五绝，黄药师仍为“东邪”。
版本差异比较
在第一版中，《九阴真经》原为黄药师“赖以成艺”的武学奇书，自第二版开始已经删改。 在旧版《倚天屠龙记》中曾叙述，之后襄阳城破，郭襄遂前往桃花岛寻找外公黄药师，发现岛上空无一人，而那艘黄药师预备殉妻用的画舫也失去踪影，从此不再见到黄药师出现。自第二版开始已经删改。 第二版中的“落英神剑掌”，在第三版中称为“桃华落英掌”。 在新版的《射雕英雄传》中，加入了黄药师与徒儿的各种新关系 。
黄药师形相清癯，身材高瘦，风姿隽爽，萧疏轩举，湛然若神，身穿青衣直缀，头戴同色方巾，文士模样 。
妻子：冯蘅
女儿：黄蓉
女婿：郭靖
外孙：郭芙、郭襄、郭破虏
外孙婿：耶律齐
徒弟：曲灵风、陈玄风、梅超风、陆乘风、武眠风、冯默风、程英
徒孙：傻姑、陆冠英
其他武功继承者：杨过
灵鳌步：低头，双臂内弯，手肘向前，似箭般向敌人胸口撞去。
附骨针：伸手在人身上轻轻一拍，那针便深入肉里，牢牢钉在骨骼的关节之中。针上喂有毒药，药性却是慢慢发作，每日六次，按着血脉运行，叫人遍尝诸般难以言传的剧烈苦痛，一时又不得死，要折磨到一两年后方取人性命 。
三招火叉、三招掌法：这六招呆呆板板，并无变化后着，威力全在功劲之上。常人练武，少则数十招，多则变化逾千，招数虽少，却也非同小可，黄药师为傻姑所创 。
八卦方位：东邪平日修习上乘内功时所用的姿式。另有数招不知其武功名字的招式，想来是普通易见的招式。招名为：回风拂柳、星河在天